MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 8801 plasmid pP880103

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011727	TAAAA	2	10	4	13	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011727	CT	3	6	25	30	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_011727	TCAAAC	2	12	34	45	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011727	CTC	2	6	4267	4272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_011727	AG	3	6	4287	4292	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011727	GACA	2	8	4332	4339	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011727	T	6	6	4346	4351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011727	ATT	2	6	4387	4392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011727	CTT	2	6	4424	4429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011727	TGT	2	6	4475	4480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011727	T	6	6	4501	4506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011727	AAC	2	6	4855	4860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011727	TA	3	6	4938	4943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011727	GAA	2	6	5003	5008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011727	ATA	2	6	5250	5255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011727	TA	3	6	5262	5267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011727	CTC	2	6	5274	5279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_011727	ATC	2	6	5331	5336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011727	TA	4	8	10730	10737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011727	ATTT	2	8	10738	10745	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011727	GAT	2	6	10792	10797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011727	TCTA	2	8	10861	10868	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_011727	TACTTA	2	12	10929	10940	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_011727	TAATT	2	10	10953	10962	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011727	AAG	2	6	10971	10976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011727	ATT	2	6	11023	11028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011727	GAT	2	6	11167	11172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011727	ATA	2	6	11191	11196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011727	CCTA	2	8	11206	11213	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_011727	ACCC	2	8	11224	11231	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
31	NC_011727	ATA	2	6	11243	11248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011727	A	8	8	11248	11255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011727	CT	4	8	11263	11270	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_011727	CTT	2	6	12222	12227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011727	GAA	2	6	12250	12255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011727	TGT	2	6	12264	12269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011727	GAC	2	6	12308	12313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011727	AC	3	6	12312	12317	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_011727	AAC	2	6	12330	12335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011727	AC	3	6	12334	12339	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_011727	GA	3	6	12972	12977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011727	T	9	9	12984	12992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011727	TCC	2	6	12998	13003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_011727	ACACC	2	10	13051	13060	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
45	NC_011727	ACA	2	6	13073	13078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011727	TCT	2	6	13399	13404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011727	CT	3	6	13403	13408	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_011727	T	8	8	16560	16567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.